Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cacna1cQ01815 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms