Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms