Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
PrcdQ00LT2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
PrcdQ00LT2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms