Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gjb2Q00977 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms