Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pitx2P97474 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms