Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Usp9xP70398 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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