Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
NficP70255 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
NficP70255 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
NficP70255 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
NficP70255 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms