Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chl1P70232 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chl1P70232 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms