Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd13P70217 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Hoxd13P70217 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Hoxd13P70217 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd13P70217 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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