Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Traf5P70191 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf5P70191 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf5P70191 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms