Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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