Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Crip1P63254 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms