Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rps11P62281 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms