Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SnnP61807 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SnnP61807 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SnnP61807 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms