Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vbp1P61759 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms