Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1aP61092 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1aP61092 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms