Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pcmtd1P59913 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pcmtd1P59913 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Pcmtd1P59913 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pcmtd1P59913 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms