Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CgnP59242 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CgnP59242 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CgnP59242 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CgnP59242 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CgnP59242 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CgnP59242 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CgnP59242 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CgnP59242 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CgnP59242 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CgnP59242 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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