Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdl3P58873 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms