Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Cldn18P56857 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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