Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bace1P56818 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bace1P56818 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bace1P56818 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bace1P56818 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms