Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apobec1P51908 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Apobec1P51908 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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