Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtshP49935 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtshP49935 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtshP49935 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtshP49935 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CtshP49935 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtshP49935 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtshP49935 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtshP49935 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtshP49935 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtshP49935 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtshP49935 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtshP49935 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtshP49935 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtshP49935 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CtshP49935 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CtshP49935 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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