Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TbcaP48428 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms