Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syt1P46096 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms