Protein–RNA interactions for Protein: P38060

Hmgcl, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgclP38060 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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HmgclP38060 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HmgclP38060 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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HmgclP38060 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
HmgclP38060 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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