Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ddit3P35639 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms