Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5cP35278 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rab5cP35278 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms