Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp4P35123 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp4P35123 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp4P35123 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp4P35123 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Usp4P35123 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usp4P35123 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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