Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm33619-201ENSMUST00000215633 662 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm20914-202ENSMUST00000188887 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm43132-201ENSMUST00000199106 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Dcpp3-201ENSMUST00000115428 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hoxa2P31245 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms