Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RxrgP28705 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RxrgP28705 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RxrgP28705 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms