Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RxraP28700 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
RxraP28700 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
RxraP28700 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
RxraP28700 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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