Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NapbP28663 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NapbP28663 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms