Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa2P28309 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa2P28309 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms