Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CftrP26361 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CftrP26361 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CftrP26361 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CftrP26361 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CftrP26361 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CftrP26361 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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