Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms