Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a2P20490 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms