Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Fcer1aP20489 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms