Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrkcaP20444 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms