Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
VimP20152 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
VimP20152 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
VimP20152 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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