Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
PdgfaP20033 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
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