Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NefhP19246 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NefhP19246 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NefhP19246 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NefhP19246 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NefhP19246 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NefhP19246 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NefhP19246 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms