Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
P18525 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
P18525 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
P18525 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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