Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gata1P17679 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.59□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms