Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa5P09021 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms