Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Spta1P08032 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Spta1P08032 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spta1P08032 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms