Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P04942 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P04942 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P04942 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms