Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
CrygdP04342 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms