Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2-Eb1P04230 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2-Eb1P04230 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms