Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxa7P02830 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms